El Director del INCAR se ve asistido en sus obligaciones por la Junta de Instituto y el Claustro científico, constituido por los científicos titulares, investigadores científicos y profesores de investigación, que es el foro de discusión de los asuntos científicos.
Además de los tres departamentos de investigación, el INCAR dispone de diversos servicios de apoyo a la investigación (gerencia, servicio de análisis, servicio de infraestructura científica, mantenimiento, biblioteca, informática y divulgación).
Director: Dr. Fernando Rubiera González
Secretaría de Dirección: Juliana Sánchez Villar
Vicedirectora de Programación, Seguimiento y Divulgación Científica: Dra. Mercedes Díaz Somoano
Vicedirector de Organización y Funcionamiento: Dr. Fabián Suárez García
Gerente: Estrella Fernández Martínez
La Junta de Instituto está integrada por el director, vicedirectores, gerente, los jefes de departamento y 3 representantes de personal. Actualmente la componen los siguientes miembros:
El claustro científico, constituido por los científicos titulares, investigadores científicos y profesores de investigación, que es el foro de discusión de los asuntos científicos.